高錳酸鹽指數是一個相對的條件性指標，其測定結果與所用蒸餾水的純度、溶液的酸度、高錳酸鹽濃度、加熱溫度和時間有關。因此，測定時必須嚴格遵守操作規定，使結果具可比性。應注意以下幾個問題：

　?。?）配置CODMn試劑要求用新鮮的蒸餾水，用重蒸水（不含還原性物質的水即：將1L蒸餾水置于全玻璃蒸餾器中，加入10mL硫酸和少量高錳酸鉀溶液，蒸餾。棄去100mL初溜液，余下溜出液貯于具玻璃塞的細口瓶中。）或超純水，而不能用去離子水。因為去離子水中含有微量樹脂浸出物和樹脂崩解微粒，不宜用于配置有機物質分析的試液。離子交換處理能除去原水中絕大部分鹽類、堿和游離酸，但不能*除去有機物。如果用含有有機物的去離子水配置CODMn試液，在做水樣時其本底值會偏高，影響對樣品水的測定。

　?。?）應先標定好0.1mol/LKMnO4(1/5KMnO4)準確濃度，再根據稀釋公式把濃度調節到0.01000—0.009600mol/L范圍內，以減小誤差。

　?。?）加入10.00ml的0.01mol/LKMnO4和0.01mol/LNa2C2O4時均應用滴定管加藥，這樣既快又準。

　?。?）加熱的時間應從水浴開始沸騰時計時，時間為30±2min，時間要卡準。加熱時間短，測定結果偏低，加熱時間長了將導致測定結果偏高。